愛媛県では、昭和45年に、支川銅山川から二級水系国領川に発電を目的とした分水を開始し、昭和37年の鹿森ダム（国領川）、昭和41年には別子ダム（銅山川）の完成により、別子分水として発電供給と工業用水の確保が図られました。一方、伊予三島市・川之江市（現在の四国中央市）への分水は、愛媛県と徳島県の協議が成立した昭和11年に事業着手し、戦争による中断をはさんで昭和28年の柳瀬ダム完成により分水が開始されました。昭和42年に、吉野川総合開発計画の早明浦ダムを中核とする吉野川水系水資源開発基本計画が閣議決定されました。昭和50年には香川県への分水が開始され、吉野川は古くより利用してきた徳島県も含めた四国4県で利用される重要水源となっています。